共和国内乱軍によって、シンビオスの故郷フラガルドが狙われているという情報を耳にしたシンビオス軍はフラガルドへと急ぎ向かった。フラガルドはシンビオスの故郷であり父コムラードが領主となっている土地である。

　いくつもの障壁を乗り越えフラガルドにたどり着いたシンビオス軍であったが、フラガルドにはすでにブルザム教が乗り込んでいたのだった。フラガルド城に入ったシンビオス軍は領地フラガルドと父コムラードを救うためブルザム司祭率いるブルザム兵団と戦うことになるのだった。

　その戦闘中フィアールと戦い、フィアールにダメージを与えると手に入る船倉のカギ。シンビオス軍がこの船倉のカギを手に入れていると、シナリオ１では共和国の鳥人ゼロはその「船倉のカギ」をもってメディオン軍へと飛んでいくことになるのだが・・・。

　この「船倉のカギ」がシナリオ２でどんな影響を及ぼすのだろうか？